卷一针道源流针灸直指针灸方宜始论刺热论刺疟论刺咳论刺腰痛论奇病论刺要论刺齐论刺志论长刺节论皮部论经络论骨空论刺水热穴论调经论缪刺论经刺论巨刺论手足阴阳流注论卫气行论诊要经终论刺禁论刺法论五刺应五脏论：
兰室秘藏
卷一风癞论受病所在经络三十六疯六经分属大麻风蛇皮风脱跟风鱼鳞风邪魅风血风鹅掌风鼓槌风血痹风糕风痛风癫风半肢风软瘫风紫云风干风干风干风白癜风蚝风历节风壁泥风疹风哑风冷麻风漏蹄风蛤蟆风核桃风水风热风雁来风
简介细目序凡例卷一卷二卷三卷四跋
《汤液本草》序一《汤液本草》序二《汤液本草》后序卷之一五脏苦欲补泻药味脏腑泻火药东垣先生药类法象用药法象药性要旨气味浓薄寒热阴阳升降图（缺）升降者天地之气交用药升降浮沉补泻法五味所用药类法象标本阴阳论
咽喉总论条目辨喉证附方咽喉七十二证考
叙卷之上卷之下
一瓢医案
序叙卷之一·元集总论辨眼症虚实论辨眼疼有虚实论辨药宜忌论辨热症有虚实气不同论辨五轮病源用药论辨五轮生克论辨心火克肺金白珠生赤丝论辨肺金克肝木黑睛生翳膜论辨眼内生云翳用凉药难退论辨眼珠生翳膜滋肾更甚论辨
仁端录