序一序二序三卷上十二经总括诊三部脉法三部九候左右三部六候四季脉名诊五脏四季常脉定四季六脏平脉定四季相克脉诊五脏贼邪脉诊四时虚实脉歌下指轻重法诊五脏动脉法诊六腑平脉法脉息大数诊五脏脉诀男女反脉观人形性脉
卷第一叙论太阳证阳明证少阳证太阴证少阴证厥阴证两感证三阴三阳传病证卷第二可发汗证不可发汗证四逆证和表证可下证（血证附）不可下证可水不可水证可吐不可吐证可灸不可灸证可火不可火证可温证火邪证卷第三结胸证心
卷之一周身经穴赋十二经脉歌十二经本一脉歌经穴起止歌十五脉络歌经脉气血多少歌禁针穴歌禁灸穴歌血忌歌逐日人神歌九宫尻神歌太乙人神歌孙思邈先生针十三鬼穴歌长桑君天星秘诀歌马丹阳天星十二穴并治杂病歌四总穴歌千
总论时气（天时一）阴阳（天时二）地利（地利一）基址（地利二）十机（人事一）附∶小产论蓄外家（人事二）药食（论方）饮食（戒饮）男病（疾病一）女病（疾病二）附：衍庆编调经至言辨古续篇大意干道（蓄德一）坤道
自序卷一调经门经水先期而来经水过期而来经行腹痛血风卷二血崩便浊白淫淋证白带血癖经准不孕热入血室卷三广嗣论胎前门受妊脉法男女脉法双胎脉法死胎脉法鬼胎脉法逐月胎形论妊娠调护法小产安胎卷四妊娠中风妊娠伤寒妊
序饮食色欲箴序阳有余阴不足论治病必求其本论涩脉论养老论慈幼论夏月伏阴在内论豆疮陈氏方论痛风论疟论病邪虽实胃气伤者勿使攻击论治病先观形色然后察脉问证论大病不守禁忌论虚病痰病有似邪祟论面鼻得冷则黑论胎自堕
治法总论用药歌血头行走穴道歌左右论药中禁忌穴名药名全身门第一头面门第二身中门第三脊背门第四腿足门第五金创门第六杖伤附通用门第七跌损妙方书后谨跋
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
自叙序凡例卷之一先天脉镜叙先天脉镜论云诊脉捷要歌照脉玄窍诀照脉口诀三焦照六腑脾照五脏十八脉形歌五运体性六气合来为邪脉左手太过脉右手太过脉左手不及脉诀右手不及脉诀调摄养生却妄远色贵达调息除烦节食慎劳酌饮
新雕百一选方序奉敕校正百一选方表《曝书亭集》所载《百一选方》跋百一选方序是斋百一选方序新刊续添是斋百一选方目录卷之一第一门（丹药）三神丹法太素丹白丹金液丹太上紫霞丹水金丹雄朱丹蜀仙丹资寿小金丹第二门（