序卷上十干脏腑配合十二支脏腑经络配合手足经络配天地四时合主表里阴阳脏腑经络病证内外八邪内外病生四类九气五邪五邪微甚十干夫妇配合成五运五运太过不及十二支应六气三阴三阳六气有余不足六气五运应五脏主病六气为
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
序凡例卷上温病总论伤寒温病辨（四则）风温上焦篇风温中焦篇风温下焦篇卷下湿温上焦篇湿温中焦篇湿温下焦篇附温病治法要略附方
卷一序论卷二卷三卷四黄父一疽论相痈疽知是非可灸法相痈知有脓可破法卷五
神农尝百草论亢则害承乃制论四气所伤论张仲景伤寒立法考伤寒温病热病说伤寒三阴病或寒或热辨阳虚阴盛阳盛阴虚论伤寒三百九十七法辨伤寒四逆厥辨呕吐干呕哕咳逆辨中风辨中暑中热辨积热沉寒论泻南方补北方论五郁论二阳
弁言杨序总评卷上卷下书《人身图说》后书《医林改错》后书《医林改错》后读《全体新论》
陆序姚序例言卷一卷二卷三附刊书札跋
序伤寒论序伤寒卒病论集卷第一辨脉法第一平脉法第二卷第二伤寒例第三辨痉湿暍脉证第四辨太阳病脉证并治法上第五桂枝汤方桂枝二越婢一汤方甘草干姜汤方芍药甘草汤方调胃承气汤方四逆汤方卷第三辨太阳病脉证并治中第六
明堂灸经
缪序卷一一、卒尸二、痹三、？（痉）四、痿五、厥六、伤寒六经余证七、大头肿痛（附:蛤蟆瘟）蛤蟆瘟八、霍乱九、瘟病十、伤暑十一、疟十二、疸十三、劳（劳极 烦热 劳瘵）劳极烦热劳瘵卷二十四、热十五、吐衄下血