序序二附录十二经见证不治已病治未病亢则害承乃制审察病机无失气宜能合色脉可以万全治病必求于本卷一中风一中寒二（附伤寒、伤风）中暑三（附暑风、注夏）中湿四瘟疫五（附大头天行病）火六卷二斑疹七疟八痢九泄泻十
自序例言卷一禀赋源流总论摄养为本总论卷二阴阳脏腑总论卷三营卫经络总论卷四上四诊合参总论卷四下经解格阳关阴脉脉应四时阴阳脉候部位脉象辨病诊脉察色观形经脉应四时十二月五脏绝脉五脏脉象辨脉平病死旺之象辨平病
序卷上疮科总论五发痈疽论五发痈疽通治方疔疮论瘰论卷下肠痈痔论乳痈论肺痈论诸疳疮论附骨疽论诸疮论疥癣论瘿瘤论疮论便毒论
序凡例卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七卷八卷九卷十附录附录
《本草衍义》提要序卷一序例上衍义总叙卷二序例中卷三序例下内容卷四玉泉丹砂空青绿青云母石钟乳朴硝芒硝硝石英硝矾石滑石紫石英白石英赤石脂白石脂石中黄子婆娑石无名异菩萨石卷五金屑银屑水银水银粉雄黄雌黄石硫黄
序校刊目经大成序魏序李序兄序自序卷首脏腑表里三阳三阴轮廓贯通（图缺）五运之图（图缺）六气之图（图缺）五轮主属形图（图缺）五轮定位形图（图缺）八廓定位形图（图缺）八廓分属形图（图缺）开导前面针穴图（图缺
序自序游艺志略自序精义汇通六经提纲六字真言六气便解医经补正治病法解一治病法解二素问摘要三证合参说寒说温风温湿温说疫辨证治法指南审脉附∶游艺志略
序自序辨病源第一辨经络第二辨色第三辨脉第四辨手太阴本病症治第五辨手少阳标病第六辨手少阴标病第七辨三经标本并病第八辨救误上第九辨救误下第十辨善后第十一辨外治第十二辨禁忌第十三辨张氏无治之症第十四辨耐修药
绪言卷一摄生第一阴阳第二脏象上第三脏象下第三卷二脉色上第四脉色下第四经络上第五卷三经络下第五标本第六气味第七论治第八卷四疾病第九病机邪气阴阳卷四疾病第十经脏虚实时令卷五疾病第十一五气情志风厥伤寒卷五疾
序卷上辨阴证阳证辨脉辨寒热辨外感八风之邪辨手心手背辨口鼻辨气少气盛辨头痛辨筋骨四肢辨外伤不恶食辨渴与不渴辨劳役受病表虚不作表实治之辨证与中热颇相似卷中饮食劳倦论补中益气汤立方本指朱砂安神丸四时用药加减